Phòng Hợp tác & Quản lý Khoa học được thành lập vào ngày 01/07/2005 theo Quyết định số 331/QĐ-ĐHMBC của Hiệu trưởng Trường Đại học Mở Bán công Tp.HCM về việc tách Phòng Quản lý Khoa học – Sau Đại học và tổ Hợp tác Quốc tế để thành lập Phòng Quản lý Sau Đại học và Phòng Hợp tác & Quản lý Khoa học.Phòng HT&QLKH có nhiệm vụ tham mưu và giúp Hiệu trưởng trong việc quản lý, tổng hợp, đề xuất ý kiến, tổ chức thực hiện các công việc liên quan đến hoạt động hợp tác, hoạt động khoa học và công nghệ.